A. Slogan
"Belajar Bersama Sukses Semua"
Terkandung makna semua civitas akademika MTsN 3 Bantul harus mau belajar. Guru yang kurang menguasai satu hal bisa belajar dengan Guru yang lain, atau dengan Pegawai TU. Sebaliknya Pegawai TU yang memiliki keterbatasan dalam suatu hal tidak malu untuk belajar dengan Pegawai TU lainnya atau Guru.
Sedangkan siswa dikedepankan sifat kerjasama dan saling membantu bila siswa lain mengalami kesulitan. Sehingga antar siswa terjalin simbiosis mutualisme saling menguntungkan dengan saling memberi masukan, tentunya bukan dalam hal mengerjakan tugas yang sifatnya individu.
Siswa juga tak segan untuk melakukan konsultasi kepada Bapak dan Ibu guru tentang materi yang belum jelas. Sehingga dengan demikian akan terjadi komunikasi 2 arah dan akan makin mendekatkan siswa dan guru secara pribadi.
Akhirnya, kalau semua pihak mau belajar bersama akan dapat mencapai kesuksesan semua. Siswa dapat meraih prestasi baik akademik maupun non akademik. Guru dapat mendidik dan melayani siswa dengan inovasi-inovasinya. Pegawai TU dapat melaksanakan tugas-tugas administrasi madrasah dengan baik.
B. Program Unggulan
1. KETAM (Kelas Tahfidz Matsaga)
Tiap jenjang dibuka 1 kelas Tahfidz. Adapun target dari kelas Tahfidz adalah siswa dapat menghafalkan minimal 3 Juz selama tiga tahun, yaitu Juz 30, Juz 1 dan Juz 2.
2. BTKG (Batik Tulis Khas Giriloyo)
Membatik dijadikan ekstra wajib untuk siswa kelas 7, serta ekstra pilihan untuk kelas 8. Pengampu kegiatan ekstra batik merupakan para pengrajin batik Giriloyo.
3. RISMA (Riset Matsaga)
Melalui program ini, siswa dilatih untuk melakukan kegiatan riset, baik untuk kepentingan pembelajaran maupun kegiatan perlombaan Myres dan sejenisnya.
4. GETER (Gelorakan Literasi)
Program wajib membaca buku untuk warga madrasah dengan target dua buku selama dua semester. Siswa dan guru didorong untuk menghasilkan karya berupa buku serta karya tulis lainnya. Juga dilakukan bimbingan dalam mempersiapkan siswa mengikuti loomba-lomba bidang literasi
5. TEMEN (Terus Mendulang Prestasi)
Pelaksanaan kegiatan bimbingan siswa untuk mengikuti kegiatan lomba akademik dan nonakademik, baik tingkat lokal, nasional, serta internasional. Target yang dicanangkan dalam setahun adalah 50 kejuaraan.
6. PUMA (Publikasi Matsaga)
Melakukan publikasi madrasah di media cetak maupun media online sebagai bentuk promosi / branding madrasah. Target berita dalam setahun adalah 600 buah
7. WALI (BerWawasan Lingkungan)
Tujuan dari program ini adalah semua warga madrasah mempunyai kepedulian dan kesadaran yang tinggi terhadap lingkungan.
Target yang dicanangkan adalah memperoleh penghargaan Sekolah Adiwiyata Tahun 2021 Tingkat Kabupaten Bantul.
8. JURIMA (Jumat Ceria Bersama)
Bentuk kegiatannya adalah pelaksanaan senam, jalan sehat atau olahraga bersama seluruh warga madrasah. Dilaksanakan pagi hari sebelum pembelajaran dimulai.
9. SERU (Sedekah Rutin)
Pembiasaan berinfak oleh warga madrasah. Kegiatan dilakukan setiap seminggu sekali yaitu hari Jum’at dan infak insidental.
10. PTSP SIP (Pelayanan Terpadu Satu Pintu SIngkat Puas)
Pelayanan terpadu dengan mengutamakan ketepatan, kecepatan, dan kenyaman untuk warga madrasah maupun masyarakat.
11. NGABULI (Pengajian Sebulan Sekali)
Kegiatan pengajian untuk orang tua/wali setiap bulan sekali di madrasah. Selain itu juga mengadakan pengajian untuk Guru dan Pegawai Tu beserta keluarga setiap 40 hari sekali.